A Bene foi fundada em 28 de setembro de 1907, quando um grupo de 12 portugueses se reuniram numa sala da Rua Saldanha Marinho com o nome de Sociedade de Beneficência Portuguesa D. Carlos I, em homenagem ao Rei de Portugal daquela época.

O Rei morreu no ano seguinte. Dois anos depois, em 1910, foi proclamada a república em Portugal e isso “destronou” D. Carlos I da condição de patrono do hospital.

A ideia da colônia lusa era construir em Ribeirão um hospital nos moldes da Beneficência Portuguesa do Rio de Janeiro. Buscou-se também o apoio de portugueses residentes em outras cidades e foram arregimentados 340 sócios, ficando estabelecido que cada um deles contribuiria com uma “jóia” de 2 mil réis e mensalidade de mil réis.

Hoje, os órgãos de governança da Bene são o Conselho Deliberativo e Conselho Executivo, que são apoiados por um Conselho Consultivo e fiscalizado por um Conselho Fiscal.